___ ___ ___ _ _ _ | | |_ | | | | | | | | | . | | | | |__ | _|___|_____| 0.7.6276M |___|_| User: ???@ion-R24-1 Date: Wed Apr 28 07:58:05 2010 Arch: BGP Pid: 100 Dir: /gpaw/lib/python2.6/site-packages/gpaw ase: /gpaw/lib/python2.6/site-packages/ase version: 3.3.1.1540 numpy: /gpaw/lib/python2.6/site-packages/numpy units: Angstrom and eV Memory estimate --------------- Calculator 1027.63 MiB Initial overhead 983.38 MiB Density 4.69 MiB Arrays 0.76 MiB Localized functions 2.19 MiB Mixer 0.28 MiB Interpolator 1.46 MiB Hamiltonian 6.25 MiB Arrays 0.50 MiB Restrictor 0.80 MiB XC 3D grid 2.32 MiB Poisson 2.46 MiB vbar 0.16 MiB Wavefunctions 33.30 MiB Arrays psit_nG 11.21 MiB Eigensolver 0.16 MiB Projectors 0.37 MiB Overlap op 21.47 MiB Kinetic operator 0.09 MiB Positions: 0 Au 18.2780 6.3343 6.6193 1 Au 16.1690 8.4433 6.6193 2 Au 14.0600 10.5523 6.6193 3 Au 20.3870 8.4433 6.6193 4 Au 18.2780 10.5523 6.6193 5 Au 22.4960 10.5523 6.6193 6 Au 11.9510 12.6613 6.6193 7 Au 9.8420 14.7703 6.6193 8 Au 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Au Au Au AuAu AuAu AuAu Au AuAu AuAu AuAAuAu AuAu AuAu Au | | | Au Au Au Au Au | | | Au Au Au AuAu Au AuAu AuAu AuAAuAu AuAu AuAu Au AuAu AuAu | | | AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au Au Au | | |Au Au AuAu AuAu AuAAuAu AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au AuAu Au | | | Au Au Au Au Au AuAu Au Au Au Au | | | Au Au Au Au Au Au AuAu Au Au Au Au Au | | .--Au-AuAu-Au-AuAu-Au-AuAu-AuAu-Au-AuAu-AuAu-AuAAuAu-AuAu---Au----------------------------. | / AuAu Au Au AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au Au / | / Au AuAu AuAu Au AuAu AuAu AuAu Au AuAu AuAu Au Au Au / | / / | / Au Au Au AuAu Au Au AuAu Au Au Au AuAu Au / | / Au AuAu AuAu Au Au AuAu Au Au Au / | / Au Au Au Au AuAu Au / | / Au Au / | / Au Au Au / | / Au Au / | / Au / | / / | / / | / / | / / | / / | / / | / / | / / | / / | / / |/ / *-----------------------------------------------------------------------------------------* Unit Cell: Periodic X Y Z Points Spacing -------------------------------------------------------------------- 1. axis: no 36.556000 0.000000 0.000000 208 0.1757 2. axis: no 0.000000 36.556000 0.000000 208 0.1757 3. axis: no 0.000000 0.000000 36.556000 208 0.1757 O-setup: name : Oxygen id : bf5065e8ba67698021b6cc4570d76377 Z : 8 valence: 6 core : 2 charge : 0.0 file : /home/kleis/gpaw-setups/O.RPBE.gz cutoffs: 0.74(comp), 1.30(filt), 0.83(core), lmax=2 valence states: energy radius 2s(2) -24.041 0.741 2p(4) -8.984 0.741 *s 3.170 0.741 *p 18.228 0.741 *d 0.000 0.741 Using partial waves for O as LCAO basis C-setup: name : Carbon id : 5e1162da8ccece2d28d8b78a977ec463 Z : 6 valence: 4 core : 2 charge : 0.0 file : /home/kleis/gpaw-setups/C.RPBE.gz cutoffs: 0.64(comp), 1.14(filt), 1.14(core), lmax=2 valence states: energy radius 2s(2) -13.815 0.635 2p(2) -5.254 0.635 *s 13.396 0.635 *p 21.957 0.635 *d 0.000 0.635 Using partial waves for C as LCAO basis Au-setup: name : Gold id : f729301af73151f9133db6f6e28f92a1 Z : 79 valence: 11 core : 68 charge : 0.0 file : /home/kleis/gpaw-setups/Au.RPBE.gz cutoffs: 1.32(comp), 2.33(filt), 2.81(core), lmax=2 valence states: energy radius 6s(1) -5.611 1.323 6p(0) -0.793 1.323 5d(10) -6.824 1.323 *s 21.600 1.323 *p 26.419 1.323 *d 20.388 1.323 Using partial waves for Au as LCAO basis Using the RPBE Exchange-Correlation Functional. Spin-Paired Calculation Total Charge: 0.000000 Fermi Temperature: 0.010000 Mode: fd Eigensolver: rmm-diis (3 nearest neighbors central finite-difference stencil) Poisson Solver: GaussSeidel (Mehrstellen finite-difference stencil) Interpolation: 6th Order Reference Energy: -289823044.358529 Gamma Point Calculation Total number of cores used: 16384 Domain Decomposition: 4 x 32 x 16 Parallelization over states: 8 Parallel eigensolver using ScaLAPACK/BLACS: 7 x 7 grid with 64 x 64 blocksize 1 k-point in the Irreducible Part of the Brillouin Zone (total: 1) Linear Mixing Parameter: 0.1 Pulay Mixing with 5 Old Densities Damping of Long Wave Oscillations: 50 Convergence Criteria: Total Energy Change per Atom: 0.001 eV / atom Integral of Absolute Density Change: 0.0001 electrons Integral of Absolute Eigenstate Change: 1e-09 Number of Bands in Calculation: 3200 Bands to Converge: Occupied States Only Number of Valence Electrons: 6181 log10-error: Total Iterations: Time WFS Density Energy Fermi Poisson iter: 1 08:02:05 -0.9 -1305.41721 4 248 iter: 2 08:03:14 -2.0 -1462.39440 9 iter: 3 08:04:23 -2.5 -1491.99897 5 iter: 4 08:05:49 -2.3 -1.4 -1438.18980 72 157 iter: 5 08:07:16 -1.7 -1.4 -1477.76611 117 175 iter: 6 08:08:45 -1.4 -1.5 -1374.94371 186 188 iter: 7 08:10:09 -2.2 -1.9 -1422.13254 7 123 iter: 8 08:11:34 -2.6 -1.9 -1413.41901 23 135 iter: 9 08:12:56 -3.0 -1.9 -1386.21667 15 99 iter: 10 08:14:21 -2.7 -2.1 -1364.79472 30 133 iter: 11 08:15:42 -3.2 -2.2 -1369.80177 6 66 iter: 12 08:17:02 -3.6 -2.2 -1372.40018 6 51 iter: 13 08:18:23 -4.1 -2.3 -1372.69626 7 77 iter: 14 08:19:44 -3.8 -2.3 -1375.04084 4 77 iter: 15 08:21:07 -3.8 -2.3 -1374.13330 7 96 iter: 16 08:22:28 -3.8 -2.4 -1373.54801 7 80 iter: 17 08:23:50 -4.1 -2.5 -1372.97113 6 92 iter: 18 08:25:11 -4.4 -2.6 -1371.85355 3 69 iter: 19 08:26:31 -4.9 -2.9 -1371.76005 4 54 iter: 20 08:27:50 -5.1 -3.0 -1371.78849 2 42 iter: 21 08:29:08 -5.1 -3.1 -1371.77566 3 34 iter: 22 08:30:28 -4.8 -3.2 -1371.88291 3 55 iter: 23 08:31:48 -5.1 -3.0 -1371.86045 3 57 iter: 24 08:33:07 -5.5 -3.2 -1371.79945 3 48 iter: 25 08:34:25 -6.0 -3.5 -1371.74055 2 25 iter: 26 08:35:43 -6.3 -3.6 -1371.75681 2 25 iter: 27 08:37:01 -6.3 -3.6 -1371.76159 2 21 iter: 28 08:38:18 -5.9 -3.7 -1371.74223 2 14 iter: 29 08:39:35 -6.4 -4.0 -1371.74842 2 18 iter: 30 08:40:52 -6.9 -4.0 -1371.77615 2 11 iter: 31 08:42:09 -7.2 -4.0 -1371.78060 2 2 iter: 32 08:43:26 -6.8 -4.0 -1371.76779 2 15 iter: 33 08:44:44 -6.5 -3.8 -1371.79490 3 25 iter: 34 08:46:01 -6.9 -3.6 -1371.78752 2 14 iter: 35 08:47:18 -7.3 -3.8 -1371.77212 2 16 iter: 36 08:48:36 -6.4 -4.0 -1371.79094 3 29 iter: 37 08:49:54 -6.7 -3.8 -1371.75980 2 21 iter: 38 08:51:12 -6.9 -3.7 -1371.76286 2 27 iter: 39 08:52:29 -7.6 -4.1 -1371.76307 2 6 iter: 40 08:53:46 -7.3 -4.1 -1371.75722 2 16 iter: 41 08:55:04 -6.9 -4.1 -1371.76177 2 22 iter: 42 08:56:21 -7.5 -4.0 -1371.76520 2 16 iter: 43 08:57:39 -7.3 -4.4 -1371.76529 2 21 iter: 44 08:58:56 -7.6 -4.0 -1371.76508 2 15 iter: 45 09:00:13 -8.0 -4.3 -1371.76616 2 11 iter: 46 09:01:29 -8.3 -4.5 -1371.76781 1 2 iter: 47 09:02:46 -7.9 -4.6 -1371.78203 2 3 iter: 48 09:04:03 -8.2 -4.8 -1371.78144 2 4 iter: 49 09:05:19 -8.6 -5.0 -1371.77162 2 2 iter: 50 09:06:35 -8.9 -5.2 -1371.76669 2 2 iter: 51 09:07:52 -9.2 -5.3 -1371.76582 2 1 ------------------------------------ Converged After 51 Iterations. Energy Contributions Relative to Reference Atoms:(reference = -289823044.35853) ------------------------- Kinetic: -6680.96971 Potential: +5382.68331 External: +0.00000 XC: -163.36504 Entropy (-ST): -0.05888 Local: +89.91507 ------------------------- Free Energy: -1371.79526 Zero Kelvin: -1371.76582 Fermi Level: -4.86992 Band Eigenvalues Occupancy 0 -29.03143 2.00000 1 -15.37454 2.00000 2 -13.41778 2.00000 3 -13.13857 2.00000 4 -13.13485 2.00000 5 -13.13345 2.00000 6 -12.85690 2.00000 7 -12.84719 2.00000 8 -12.84556 2.00000 9 -12.74818 2.00000 10 -12.74253 2.00000 11 -12.71737 2.00000 12 -12.66637 2.00000 13 -12.51114 2.00000 14 -12.50747 2.00000 15 -12.48401 2.00000 16 -12.48165 2.00000 17 -12.44422 2.00000 18 -12.40590 2.00000 19 -12.40529 2.00000 20 -12.40010 2.00000 21 -12.21327 2.00000 22 -12.21321 2.00000 23 -12.21030 2.00000 24 -12.13010 2.00000 25 -12.12791 2.00000 26 -12.12666 2.00000 27 -12.10526 2.00000 28 -12.10395 2.00000 29 -11.98143 2.00000 30 -11.97759 2.00000 31 -11.97558 2.00000 32 -11.97521 2.00000 33 -11.92191 2.00000 34 -11.90102 2.00000 35 -11.90087 2.00000 36 -11.89836 2.00000 37 -11.75948 2.00000 38 -11.75742 2.00000 39 -11.75605 2.00000 40 -11.71381 2.00000 41 -11.71264 2.00000 42 -11.65130 2.00000 43 -11.64478 2.00000 44 -11.64412 2.00000 45 -11.64267 2.00000 46 -11.63276 2.00000 47 -11.63218 2.00000 48 -11.57284 2.00000 49 -11.57127 2.00000 50 -11.56973 2.00000 51 -11.54060 2.00000 52 -11.41215 2.00000 53 -11.41051 2.00000 54 -11.40918 2.00000 55 -11.40805 2.00000 56 -11.39844 2.00000 57 -11.39690 2.00000 58 -11.39609 2.00000 59 -11.39474 2.00000 60 -11.39216 2.00000 61 -11.39049 2.00000 62 -11.35852 2.00000 63 -11.35698 2.00000 64 -11.35697 2.00000 65 -11.26035 2.00000 66 -11.25886 2.00000 67 -11.25838 2.00000 68 -11.19929 2.00000 69 -11.19653 2.00000 70 -11.19592 2.00000 71 -11.19486 2.00000 72 -11.18198 2.00000 73 -11.18067 2.00000 74 -11.17873 2.00000 75 -11.17758 2.00000 76 -11.16729 2.00000 77 -11.16704 2.00000 78 -11.16568 2.00000 79 -11.15346 2.00000 80 -11.15107 2.00000 81 -11.14930 2.00000 82 -11.14805 2.00000 83 -11.13097 2.00000 84 -11.13053 2.00000 85 -11.11049 2.00000 86 -11.11034 2.00000 87 -11.10987 2.00000 88 -11.10118 2.00000 89 -11.10108 2.00000 90 -11.07752 2.00000 91 -11.07751 2.00000 92 -11.07618 2.00000 93 -11.06826 2.00000 94 -11.06681 2.00000 95 -11.06535 2.00000 96 -10.95577 2.00000 97 -10.94964 2.00000 98 -10.94681 2.00000 99 -10.94453 2.00000 100 -10.94342 2.00000 101 -10.94334 2.00000 102 -10.94282 2.00000 103 -10.94190 2.00000 104 -10.94123 2.00000 105 -10.93958 2.00000 106 -10.93917 2.00000 107 -10.93913 2.00000 108 -10.93899 2.00000 109 -10.93816 2.00000 110 -10.91155 2.00000 111 -10.91145 2.00000 112 -10.91060 2.00000 113 -10.90398 2.00000 114 -10.90289 2.00000 115 -10.89382 2.00000 116 -10.89134 2.00000 117 -10.89038 2.00000 118 -10.86642 2.00000 119 -10.86638 2.00000 120 -10.86353 2.00000 121 -10.86173 2.00000 122 -10.84846 2.00000 123 -10.84719 2.00000 124 -10.84515 2.00000 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2960 -6.30168 2.00000 2961 -6.30052 2.00000 2962 -6.29977 2.00000 2963 -6.29709 2.00000 2964 -6.29627 2.00000 2965 -6.29449 2.00000 2966 -6.28062 2.00000 2967 -6.27788 2.00000 2968 -6.27623 2.00000 2969 -6.27475 2.00000 2970 -6.26966 2.00000 2971 -6.26902 2.00000 2972 -6.26813 2.00000 2973 -6.25510 2.00000 2974 -6.25471 2.00000 2975 -6.24863 2.00000 2976 -6.24784 2.00000 2977 -6.21161 2.00000 2978 -6.17176 2.00000 2979 -6.16317 2.00000 2980 -6.16257 2.00000 2981 -6.15876 2.00000 2982 -6.07824 2.00000 2983 -6.07566 2.00000 2984 -6.02003 2.00000 2985 -6.00552 2.00000 2986 -6.00405 2.00000 2987 -5.99681 2.00000 2988 -5.97791 2.00000 2989 -5.97677 2.00000 2990 -5.97612 2.00000 2991 -5.94612 2.00000 2992 -5.94023 2.00000 2993 -5.91797 2.00000 2994 -5.91790 2.00000 2995 -5.91234 2.00000 2996 -5.89578 2.00000 2997 -5.88413 2.00000 2998 -5.88091 2.00000 2999 -5.87301 2.00000 3000 -5.86980 2.00000 3001 -5.84666 2.00000 3002 -5.82883 2.00000 3003 -5.82859 2.00000 3004 -5.82300 2.00000 3005 -5.80458 2.00000 3006 -5.80379 2.00000 3007 -5.79687 2.00000 3008 -5.78658 2.00000 3009 -5.78580 2.00000 3010 -5.75538 2.00000 3011 -5.73934 2.00000 3012 -5.73323 2.00000 3013 -5.73282 2.00000 3014 -5.72940 2.00000 3015 -5.72345 2.00000 3016 -5.72104 2.00000 3017 -5.71803 2.00000 3018 -5.71533 2.00000 3019 -5.71279 2.00000 3020 -5.70936 2.00000 3021 -5.70932 2.00000 3022 -5.68758 2.00000 3023 -5.68046 2.00000 3024 -5.67897 2.00000 3025 -5.67638 2.00000 3026 -5.67561 2.00000 3027 -5.66926 2.00000 3028 -5.66921 2.00000 3029 -5.66812 2.00000 3030 -5.66737 2.00000 3031 -5.60881 2.00000 3032 -5.56986 2.00000 3033 -5.56683 2.00000 3034 -5.53364 2.00000 3035 -5.47285 2.00000 3036 -5.41599 2.00000 3037 -5.41295 2.00000 3038 -5.40973 2.00000 3039 -5.38490 2.00000 3040 -5.37157 2.00000 3041 -5.36465 2.00000 3042 -5.35543 2.00000 3043 -5.35111 2.00000 3044 -5.34614 2.00000 3045 -5.34571 2.00000 3046 -5.33775 2.00000 3047 -5.33122 2.00000 3048 -5.33033 2.00000 3049 -5.31177 2.00000 3050 -5.31119 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0.00000 3187 -3.78867 0.00000 3188 -3.78485 0.00000 3189 -3.78199 0.00000 3190 -3.77426 0.00000 3191 -3.72453 0.00000 3192 -3.72297 0.00000 3193 -3.64406 0.00000 3194 -3.64283 0.00000 3195 -3.63780 0.00000 3196 -3.63198 0.00000 3197 -3.62279 0.00000 3198 -3.62238 0.00000 3199 -3.61898 0.00000 Total Charge: -0.000000 electrons Dipole Moment: [ 0.01051495 -0.04679784 -0.02011543] Memory usage: 983.38 MB ============================================================ Timing: incl. excl. ============================================================ Initialization: 141.986 12.844 0.3% | Hamiltonian: 22.777 0.001 0.0% | Atomic: 0.000 0.000 0.0% | Communicate energies: 6.859 6.859 0.2% | Hartree integrate/restrict: 0.008 0.008 0.0% | Initialize Hamiltonian: 0.023 0.023 0.0% | Poisson: 15.538 15.538 0.4% | XC 3D grid: 0.347 0.347 0.0% | vbar: 0.001 0.001 0.0% | LCAO initialization: 106.365 5.289 0.1% | LCAO eigensolver: 38.289 0.020 0.0% | Atomic Hamiltonian: 0.000 0.000 0.0% | Blacs Orbital Layouts: 34.774 0.002 0.0% | General diagonalize: 32.955 32.955 0.8% | Redistribute coefs: 1.767 1.767 0.0% | Send coefs to domains: 0.049 0.049 0.0% | Calculate projections: 0.000 0.000 0.0% | Distribute overlap matrix: 3.473 0.930 0.0% | Distribute overlap matrix: 2.543 2.543 0.1% | Potential matrix: 0.023 0.023 0.0% | LCAO to grid: 0.014 0.014 0.0% | Set positions (LCAO WFS): 62.773 5.899 0.1% | Basic WFS set positions: 0.002 0.002 0.0% | Basis functions set positions: 0.102 0.102 0.0% | Distribute overlap matrix: 4.424 4.424 0.1% | TCI: Calculate S, T, P: 52.346 52.346 1.2% | SCF-cycle: 4044.912 89.378 2.1% || Density: 9.590 0.012 0.0% | Atomic density matrices: 0.004 0.004 0.0% | Mix: 0.814 0.814 0.0% | Multipole moments: 5.071 5.071 0.1% | Pseudo density: 3.689 3.689 0.1% | Hamiltonian: 493.823 0.026 0.0% | Atomic: 0.007 0.007 0.0% | Communicate energies: 329.763 329.763 7.9% |--| Hartree integrate/restrict: 0.369 0.369 0.0% | Poisson: 146.096 146.096 3.5% || XC 3D grid: 17.508 17.508 0.4% | vbar: 0.053 0.053 0.0% | Orthonormalize: 838.661 0.024 0.0% | Blacs Band Layouts: 50.992 0.004 0.0% | Inverse Cholesky: 50.988 50.988 1.2% | calc_matrix: 498.925 498.925 11.9% |----| rotate_psi: 288.719 288.719 6.9% |--| RMM-DIIS: 1569.229 965.704 23.1% |--------| precondition: 603.526 603.526 14.4% |-----| Subspace diag: 1044.230 0.021 0.0% | Blacs Band Layouts: 445.862 0.010 0.0% | Diagonalize: 445.835 445.835 10.6% |---| Distribute results: 0.017 0.017 0.0% | calc_matrix: 316.000 316.000 7.5% |--| rotate_psi: 282.346 282.346 6.7% |--| Other: 1.570 1.570 0.0% | ============================================================ Total: 4188.468 100.0% ============================================================ date: Wed Apr 28 09:07:53 2010